Рубен Лима, родившийся в Лиссабоне в 1989 году, начинал свою карьеру в академии СЛ Бенфика. В сезоне 2007–08 он был переведен в основную команду, но затем был отдан в аренду в КД Авеш. В 2009 году Лима перешел в Виторию де Сетубал, где дебютировал в Примейра Лиге. После завершения контракта с Бенфикой он подписал соглашение с СК Бейра-Мар. В 2011 году Лима впервые покинул Португалию, присоединившись к хорватскому Хайдуку Сплит, где быстро стал основным левым защитником. В 2013 году он перешел в ГНК Динамо Загреб, где продолжил свою карьеру.